玛丽与魔女之花讲述的是对天空和飞行员抱有憧憬，不放弃追逐梦想的女主角岩仓舞的故事。 时代从90年代开始到现在，以制造业而闻名的大坂府东大坂和自然丰富的长崎、五岛列岛为舞台。 即使立志成为飞行员，也要直面严峻的现实，以新的形式去寻找通往天空的梦想。